Strukturforutsigelse og beregning av antistoffdesign

Betydningen av antistoffer i helsevesenet og bioteknologibransjen krever kunnskap om deres strukturer i høy oppløsning. Denne informasjonen brukes til proteinkonstruksjon, modifisering av antigenbindingsaffinitet og identifisering av en epitop av et gitt antistoff. Røntgenkrystallografi er en tydelig brukt handling for å bestemme antistoffstrukturer. Selv om det å krystallisere et antistoff ofte er arbeidskrevende og tidkrevende. Beregningsmessige tilnærminger gir et billigere og raskere alternativ til krystallografi, men resultatene er mer tvetydige, siden de ikke produserer empiriske strukturer. Online webservere som illustrert av Web Antibody Modelling (WAM) og Prediction of Immunoglobulin constitution (PIGS) muliggjør beregningsmodellering av antistoff variable regioner. Rosetta Antibody er et nytt antistoff F V region constitution prediction server, som inkluderer sofistikerte teknikker for å minimere CDR-løkker og optimalisere den relative orienteringen til de lette og tunge kjedene, i tillegg som homologimodeller som forutsier vellykket docking av antistoffer med deres unike antigen.

Bilde 396A | Mekanisme for rekombinering av klassebrytere som tillater bytte av isotype i aktiverte B-celler | EN: Bruker: Ciar / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Class_switch_recombination.png) fra Wikimedia Commons

Bilde 396A | Mekanisme for rekombinering av klassebrytere som tillater bytte av isotype i aktiverte B-celler | EN: Bruker: Ciar / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Class_switch_recombination.png) fra Wikimedia Commons

Forfatter : Merim Kumars

Referanser:

Medisinsk mikrobiologi II: Sterilisering, laboratoriediagnostikk og immunrespons

Molekylær diagnostikk i mikrobiologi

Kommentarer