Programvare for bioinformatikk og design

Bruken av plasmider som en teknikk i molekylærbiologi støttes av bioinformatikk-programvare. Disse programmene registrerer DNA sammenbindingen av plasmidvektorer, hjelper til med å forutsi kuttede steder med begrensningsenzymer og planlegge manipulasjoner. Eksempler på programvarepakker som håndterer plasmidkart er ApE, Clone Manager, GeneConstructionKit, Geneious, Genome Compiler, LabGenius, Lasergene, MacVector, pDraw32, Serial Cloner, VectorFriends, Vector NTI og WebDSV. Disse programvarestykkene hjelper til med å utføre hele eksperimenter i silico før de gjør våte eksperimenter.

Plasmidsamlinger

Mange plasmider er blitt opprettet gjennom årene, og forskere har gitt ut plasmider til plasmiddatabaser, for eksempel de ideelle organisasjonene Addgene og BCCM / LMBP. Man kan identifisere og oppsøke plasmider fra disse databasene for forskning. Forskere laster dessuten ofte opp plasmidsekvenser til NCBI -databasen, hvorfra sekvenser av spesifikke plasmider kan hentes.

Bilde 239A | En skjematisk fremstilling av pBR322 -vektoren med begrensningsseter angitt i blått. | Ayacop (+ Yikrazuul) / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:PBR322.svg) from Wikimedia Commons

Forfatter : Milos Pawlowski

Referanser:

Molekylærbiologiteknikker II

Teknikker for molekylærbiologi V