Forhold til en annen forsterkningsteknikk

RPA er en av flere isotermiske nukleinsyreforsterkningsteknikker som skal utvikles som en molekylær diagnostisk teknikk, ofte med det formål å forenkle laboratorieinstrumenteringen som er nødvendig i forhold til PCR. En delvis liste over en annen isoterm amplifiseringsteknikk inkluderer LAMP, NASBA, helicase-avhengig amplifisering (HDA) og nicking enzym amplification reaksjon (NÆR). Teknikkene varierer i forhold til primerlayout og reaksjonsmekanisme, og i noen tilfeller (som RPA) bruker man cocktailer av to eller flere enzymer. I likhet med RPA tilbyr mange av disse teknikkene raske amplifiseringstider med potensial for forenklet instrumentering, og rapporterte motstand mot stoffer i uprenerte prøver som er kjent for å hemme PCR. Respekt for forsterkningstid kan moderne termosyklere med raske temperaturramper redusere PCR forsterkningstidene til mindre enn 30 minutter, spesielt for korte amplikoner som bruker syklus med dobbelt temperatur i stedet for de konvensjonelle tretemperaturprotokollene. I tillegg bør kravene til prøveforberedelse (inkludert lysering og ekstraksjon av DNA eller RNA, om nødvendig) betraktes som en del av den typisk tid og kompleksitet som ligger i teknikken. Disse kravene varierer i henhold til teknikken i tillegg til spesifikk mål og prøvetype.

Bilde 249A | En skjematisk fremstilling av den molekylære mekanismen som er involvert for screening av rekombinante celler | Dylan2106 / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Blue_white_assay_Ecoli.jpg) from Wikimedia Commons

Bilde 249A | En skjematisk fremstilling av den molekylære mekanismen som er involvert for screening av rekombinante celler | Dylan2106 / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Blue_white_assay_Ecoli.jpg) from Wikimedia Commons

Forfatter : Milos Pawlowski

Referanser:

Molekylærbiologiteknikker II

Teknikker for molekylærbiologi V

Kommentarer