Storskala sekvensering tar ofte sikte på å sekvensere veldig lange DNA stykker, som vist av hele kromosomer, til tross for at storskala sekvensering på lignende måte kan brukes til å generere veldig stort antall korte sekvenser, som vist i phage display. For lengre mål som vist ved kromosomer, består vanlige tilnærminger av å kutte (med begrensningsenzymer) eller skjære (med mekaniske krefter) store DNA fragmenter i kortere DNA fragmenter. Det fragmenterte DNA kan deretter klones inn i en DNA -vektor og amplifiseres i en bakterievert som vist av Escherichia coli. Kort DNA fragmenter renset fra individuelle bakteriekolonier blir indikativt sekvensert og satt sammen elektronisk til en lang sammenhengende sammenkonkurtering. Studier har vist at å legge til et trinn for valg av størrelse for å samle DNA fragmenter av ensartet størrelse kan forbedre sekvenseringseffektiviteten og nøyaktigheten til genomsamlingen. I disse studiene har automatisert dimensjonering vist seg å være mer reproduserbar og presis enn manuell gelstørrelse.
Bilde 149A | Et eksempel på resultatene av automatisert kjede-terminering DNA -sekvensering. | Abizar på engelsk Wikipedia / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Radioactive_Fluorescent_Seq.jpg) fra Wikimedia Commons
Forfatter : Milos Pawlowski
Kommentarer
Legg inn en kommentar